Le système cardio-vasculaire: hypotension, tachycardie.
Système digestif: nausées et vomissements, diarrhée (avec une dose unique supérieure à 60 mg / kg), un goût désagréable dans la bouche.
Système respiratoire: irritation de la membrane muqueuse de la cavité nasale (avec application intranasale), toux, sensation de brûlure et douleur thoracique, bronchospasme (avec application par inhalation).
Système urinaire: hématurie.
Du système nerveux: maux de tête, fatigue, irritabilité, dépression, encéphalopathie (en association avec l'ifosfamide).
Dermatologique phlébite au site d'administration (rarement).
Hypersensibilité réactions allergiques.
Cancérogénicité (mutagénicité): des études de cancérogénicité du mesna n'ont pas été réalisées. Mutagène dans le test d'Ames sur Salmonella typhimurium, un test micronucléaire chez la souris, augmente la fréquence des échanges de chromatides sœurs et des aberrations chromosomiques des lymphocytes stimulés par la PHA in vitro.
Autres: douleur dans les extrémités.