Le chlorure de benzalkonium est une substance cationique tensioactive dont l'effet spermatocide est dû à la capacité à endommager les membranes des spermatozoïdes (au début des flagelles, puis des têtes), ce qui rend impossible la fécondation avec des spermatozoïdes endommagés. L'effet se développe à travers 5 mni après l'introduction dans le vagin. N'affecte pas la microflore normale du vagin (y compris le bâton de Dodderlein) et le fond hormonal.
In vitro actif en ce qui concerne Neisseria gonorrhoeae, Chlamydia spp., Trichomonas vaginalis, Herpès simplex un type 2, Staphylococcus aureus. Il a un impact sur Mycoplasme spp. et a peu d'effet sur Gardnerella vaginalis, Candida albicans, Haemophilus ducreyi et Treponema pallidum.