Le clotrimazole est un agent antifongique à large spectre à usage externe. L'effet antimycosique du clotrimazole (un dérivé d'imidazole) est associé à une perturbation de la synthèse de l'ergostérol, qui fait partie de la membrane cellulaire des champignons, qui modifie la perméabilité, les membranes et provoque une lyse cellulaire subséquente. En petites concentrations, il agit de manière fongistatique, et en grandes concentrations il agit fongicide, et pas seulement sur les cellules proliférantes.Dans les concentrations fongicides, il interagit avec les enzymes mitochondriales et peroxydases, entraînant une augmentation de la concentration de peroxyde d'hydrogène à un niveau toxique, ce qui contribue également à la destruction des cellules fongiques.
Efficace contre les dermatophytes, les levures et les moisissures,] ainsi que l'agent responsable du lichen multicolore Pityriasis versicolor (Malassezia furfur).