Hématologique: anémie, leucopénie, thrombocytopénie. De la part du tractus gastro-intestinal: nausées et vomissements, diarrhée, perte d'appétit, douleurs abdominales, stomatite. Du système urinaire: une augmentation modérée de la concentration d'urée et de la créatinine dans le sang, une violation de la fonction rénale, la cystite.so le système nerveux (plus prononcé avec l'introduction de fortes doses, réversible après l'abolition de l'altrétamine): central et neurotoxicité périphérique. Dermatologique: alopécie. Hypersensibilité: démangeaisons cutanées, éruptions cutanées.
De la part du système reproducteur: suppression gonadique (aménorrhée ou azoospermie), en particulier en combinaison avec des agents alkylants. Les effets dépendent de la dose et de la durée du traitement et peuvent être irréversibles. Avec l'introduction d'altrétamine chez les rats femelles avant l'accouplement pendant 14 jours, l'effet sur la fertilité n'est pas établi. Lorsque 120 mg / m2 par jour est administré à des rats mâles 60 jours avant l'accouplement, provoque une atrophie testiculaire, diminue la fertilité et, possiblement, a un effet mutagène dominant létal; à une dose de 450 mg / m2 par jour pendant 10 jours réduit la spermatogenèse, provoque une atrophie des testicules, des vésicules séminales et de la prostate ventrale.
Cancérogénicité (mutagénicité): les tumeurs malignes secondaires sont un effet secondaire potentiel retardé de nombreux médicaments antitumoraux. On ne sait pas si cela est dû à leur effet mutagène ou immunosuppresseur. L'effet de la dose et de la durée du traitement est inconnu, mais on suppose que le risque augmente avec l'utilisation prolongée. Un cas de développement de la leucémie aiguë myéloblastique est décrit dans le traitement avec l'altrétamine. La préparation montre une faible mutagénicité pour la souche TA100 Salmonella typhimurium.
Autres: hépatotoxicité, syndrome grippal, fièvre, infections, augmentation de l'activité de la phosphatase alcaline dans le sang.