Les effets secondaires de la protionamide se manifestent à partir du tractus gastro-intestinal, du foie, de la peau, du système endocrinien et du système nerveux.
Du système digestif: perte d'appétit, nausée, vomissement, diarrhée, sécheresse ou hypersalivation, goût métallique dans la bouche. Après le retrait du médicament, ces phénomènes ont tendance à passer rapidement.
Souvent, pendant le traitement, il y a une augmentation du taux sanguin de transaminases. Les violations rares de la fonction hépatique avec des signes d'hépatite et d'ictère sont rares. L'hépatotoxicité du médicament dépend des violations existantes du foie, telles que les lésions hépatiques dues à l'alcoolisme ou les interventions postopératoires. Ces effets secondaires sont notés en particulier en association avec l'isoniazide, la rifampicine et le pyrazinamide.
Réactions cutanées sont rares, dans certains cas décrits des réactions de type pellagrope, respectivement, avec une combinaison de manifestations cutanées et de troubles du système nerveux central.
Parfois noté troubles du système endocrinien. Parallèlement au développement de l'hypoglycémie (diminution de la glycémie inférieure à 50 mg%) chez les patients diabétiques, le développement de la gynécomastie (augmentation des glandes mammaires chez l'homme) est décrit. Rarement il y a une violation du cycle menstruel et de l'impuissance, ainsi que l'hypothyroïdie (une diminution des fonctions de la glande thyroïde).
Du système nerveux: insomnie, agitation, dépression, anxiété, rarement - étourdissements, somnolence, maux de tête, faiblesse, troubles de la concentration, troubles mentaux, dans des cas isolés - paresthésie. Rarement, névrite optique. Dans certains cas, des réactions allergiques et des troubles de la moelle osseuse sont décrits.
Du système cardiovasculaire: tachycardie, hypotension orthostatique.