Da streng kontrollierte Studien zur Beurteilung des Profils unerwünschter Ereignisse von Natriumthiosulfat fehlen, kann die Inzidenz von Nebenwirkungen, die in der medizinischen Literatur berichtet werden, nicht geschätzt werden.
Allergische Reaktionen, Blutdrucksenkung, Kopfschmerzen, Orientierungslosigkeit, Übelkeit, Erbrechen, verlängerte Blutungszeit, salziger Geschmack im Mund, Hitzegefühl im ganzen Körper.
Die schnelle Verabreichung oder Verabreichung von hohen Dosen von Natriumthiosulfat wurde von einer höheren Inzidenz von Übelkeit und Erbrechen begleitet.