Therapeutische Dosen von Pyridoxin schwächen die Antiparkinsonwirkung von Levodopa, verstärken die Wirkung von Diuretika.
Isoniazid, Penicillamin, Cycloserin und estrogenhaltige orale Kontrazeptiva schwächen die Wirkung von Pyridoxin.
Kombiniert mit Herzglykosiden (Pyridoxin fördert eine Steigerung der Synthese von kontraktilen Proteinen im Myokard) mit Glutaminsäure und Kalium- und Magnesiumasparaginat.
Pyridoxin ist pharmazeutisch inkompatibel mit Thiamin (B1) Vitaminen und Cyanocobalamin (B 12).
Die gleichzeitige Anwendung von Pyridoxin mit Cycloserin, Ethionamid, Hydralazin, Azathioprin, Chlorambucil, Corticotropin, Cyclophosphamid, Cyclosporin, Mercaptopurin, Penicillamin - kann Anämie und Neuropathie verursachen.