Augmente la probabilité d'effets secondaires des glucocorticostéroïdes, des minéralocorticostéroïdes (hypernatrémie), des fonds pour l'anesthésie générale (augmente le risque d'arythmies ventriculaires), des xanthines et des médicaments qui excitent le système nerveux central (augmente la neurotoxicité), des bêta-adrénergiques.
Les médicaments antidiarrhéiques et les entérosorbants réduisent l'absorption de l'aminophylline.
Rifampicine, phénobarbital, phénytoïne, isoniazide, carbamazépine, sulfinpyrazone, aminoglutéthimide, les contraceptifs oraux contenant de l'œstrogène et la moracisine, en tant qu'inducteurs d'enzymes hépatiques microsomales, augmentent la clairance de l'aminophylline, ce qui peut nécessiter une augmentation de sa dose.
En association avec des antibiotiques du groupe des macrolides, lincomycine, allopurinol, cimétidine, isoprénaline, énoxacine, petites doses d'éthanol, disulfirame, fluoroquinolones, interféron-alpha recombinant, méthotrexate, mexilétine, propafénone, tiabendazole, ticlopidine, vérapamil et vaccination antigrippale, l'aminophylline peut augmenter, ce qui peut nécessiter une réduction de sa dose.
Renforce l'action des béta-adrénostimulateurs et des diurétiques (notamment en augmentant la filtration glomérulaire), réduit l'efficacité du lithium et des bêta-bloquants.
Compatible avec les antispasmodiques, ne pas utiliser avec d'autres dérivés de la xanthine.