Allopurinol, antidépresseurs (inhibiteurs de la MAO), acide valproïque et ses sels, vérapamil, diltiazem, disulfirame, isoniazide, kétoconazole, lovastatine, les macrolides, métronidazole, oméprazole, propranolol, fluconazole, fluoroquinolones, quinidine, la quinine, chloramphénicol, cimétidine, les contraceptifs oraux contenant des œstrogènes (inhibiteurs de l'isoenzyme 2D6, 3A du cytochrome P450) augmentent la toxicité de l'ondansétron.
Barbituriques, glutéthimide, griséofulvine, oxyde de diazote, carbamazépine, carisoprodol, papavérine, rifampicine, le tolbutamide, phénylbutazone, phénytoïne (et éventuellement d'autres hydantoïnes) diminuent l'efficacité de l'ondansétron.
La dexaméthasone avec une dose intraveineuse unique de 20 mg avant le début de la chimiothérapie augmente l'efficacité de l'ondansétron.
Lorsque le vanundanib a été utilisé conjointement avec l'ondansétron, un effet additif insignifiant sur l'allongement de l'intervalle QTc a été observé (environ 10 msec), donc l'utilisation concomitante de ces médicaments Non recommandé.Dans le cas de l'ondansétron associé au vandétanib, une surveillance attentive est requise pour la concentration d'électrolytes dans le sérum et ECG, ainsi que la thérapie intensive de tous les troubles.
Il devrait éviter l'utilisation de torémifène avec ondansetron (peut prolonger l'intervalle QT). Si l'ondansétron est nécessaire, il est recommandé d'interrompre le traitement par le torémifène. Si l'interruption du traitement par le torémifène n'est pas possible, une surveillance attentive ECG.