Du système nerveux: maux de tête, diminution de l'acuité visuelle, ataxie, désorientation.
Du système digestif: gastrite érosive, colite pseudomembraneuse, diminution de l'appétit, nausées, vomissements, diarrhée (habituellement temporaire).
Foie: augmentation de l'activité des transaminases et de la concentration de bilirubine dans le sang; hépatite médicamenteuse. Facteurs de risque: alcoolisme, maladie hépatique, association avec d'autres médicaments hépatotoxiques.
Réactions allergiques éruption cutanée, urticaire, arthralgie, fièvre, bronchospasme, réactions allergiques sévères, éosinophilie, œdème de Quincke; syndrome de la peau (au début du traitement), se manifestant par une rougeur, des démangeaisons de la peau du visage et de la tête, des larmes.
Syndrome de Grippopodobny: mal de tête, fièvre; douleur dans les os (se développe habituellement avec la prise irrégulière de la drogue).
Réactions hématologiques purpura thrombocytopénique (parfois avec saignement pendant un traitement intermittent); neutropénie (plus souvent chez les patients recevant rifampicine en association avec le pyrazinamide et l'isoniazide),
Du système urinaire: insuffisance rénale réversible, néphronécrose, néphrite interstitielle.
Autre: leucopénie, dysménorrhée, induction de la porphyrie, myasthénie, hyperuricémie, exacerbation de la goutte.
Les réactions locales: phlébite au site d'administration.
En cas d'admission irrégulière ou de reprise du traitement après une pause, des réactions cutanées, une anémie hémolytique, sont possibles.
Le risque de réactions indésirables augmente avec un traitement prolongé par le médicament, ainsi qu'avec combinaison de rifampicine avec l'isoniazide.