Pour atteindre l'effet thérapeutique maximal, il est nécessaire de commencer à utiliser le médicament le plus tôt possible après le début de l'infection (dès les premiers signes de la maladie: brûlure, démangeaisons, picotements, sensation de tension et de rougeur).
Pommade n'est pas recommandé d'être appliqué sur les muqueuses de la bouche et des yeux, car il est possible de développer une inflammation locale prononcée. Dans le traitement de l'herpès génital, les rapports sexuels ou l'utilisation du préservatif doivent être évités, car l'utilisation de l'acyclovir n'empêche pas la transmission du virus aux partenaires.