Aus der Hämatopoese: Leukopenie, Neutropenie, Lymphopenie (insbesondere T-Lymphozyten), Thrombozytopenie, Anämie.
Aus dem Verdauungssystem: Anorexie, Übelkeit, Erbrechen, Stomatitis, Gingivitis, Glossitis, Pharyngitis, selten - Enteritis, Durchfall, erosive und Colitis Läsionen und Blutungen aus dem Magen-Darm-Trakt, in einigen Fällen (bei langfristiger täglicher Anwendung) - Leberfunktionsstörungen, erhöhte Aktivität von "Leber" Transaminase, periportale Fibrose und Leberzirrhose, Lebernekrose, Fettleber, Pankreatitis.
Aus dem Nervensystem: Enzephalopathie, insbesondere bei intrathekaler Mehrfachdosis, sowie bei Patienten, die eine Strahlentherapie in der Schädelregion erhielten. Es gibt auch Berichte über Müdigkeit, Schwäche, Verwirrtheit, Ataxie, Tremor, Irritationen, Krämpfe und Koma. Akute Nebenwirkungen, die durch intrathekale Verabreichung von Methotrexat verursacht werden, können Schwindel, verschwommene Sicht, Kopfschmerzen, Rückenschmerzen, steifer Nacken, Krämpfe, Lähmungen, Hemiparese einschließen.
Aus dem Atmungssystem: selten - interstitielle Pneumonitis, Lungenfibrose, Exazerbation von Lungeninfektionen.
Aus dem Harnsystem: Zystitis, Nephropathie, eingeschränkte Nierenfunktion (erhöhter Kreatininspiegel, Hämaturie).
Auf Seiten des Fortpflanzungssystems: Verletzung des Prozesses der Oogenese, Spermatogenese, verminderte Libido / Impotenz, Veränderungen der Fruchtbarkeit, teratogene Effekte.
Von der Haut und den Hautanhangsgebilden: kutanes Erythem und / oder Hautausschlag, Hautjucken, Urtikaria, Teleangiektasie, Furunkulose, Depigmentierung oder Hyperpigmentierung, Akne, Hautschuppen, Follikulitis, Alopezie (selten), erhöhte Lichtempfindlichkeit, Exazerbation der Strahlungsdermatitis.
Von den Sinnesorganen: Konjunktivitis, übermäßiger Tränenfluss, Katarakt, Photophobie, kortikale Blindheit (in hohen Dosen), Sehbehinderung.
Allergische Reaktionen: Fieber, Schüttelfrost, Hautausschlag, Nesselsucht, Anaphylaxie, malignes exsudatives Erythem (Stevens-Johnson-Syndrom), toxische epidermale Nekrolyse (Lyell-Syndrom).
Andere: Immunsuppression (verringerte Resistenz gegen Infektionskrankheiten), Unwohlsein, Osteoporose, Hyperurikämie, Vaskulitis, Arthralgie / Myalgie.